雖然《寶可夢》系列是任天堂的招牌游戲之一，但是就像制作人增田順一一直強調的那樣，《寶可夢》并不是任天堂的第一方陣容，而是GameFreak制作的第二方作品。不過雖然一直強調其獨立性，但是在最近任天堂的計劃中原本與任天堂分開獨立的GameFreak或許將在新計劃中與東京任天堂分部做鄰居。

　　根據1月末任天堂的新一屆股東大會上，古川俊太郎宣布任天堂將把東京的四個獨立的辦事處整合在“神田????”的8、20與21層，而這其中就將包含GameFreak。這也就是說GameFreak即將和任天堂的東京分部做鄰居。

　　這一變動讓玩家們開始猜測是否代表著任天堂將會逐步收購GameFreak，因為此前已經有GameFreak將同為寶可夢公司的股東合作方的Creatures從合作伙伴中刪除之事。這讓很多玩家都開始猜想GameFreak將不再保持獨立地位，不過任天堂的這一整合很可能只是將擁有緊密業務合作的廠商聯系的更緊密罷了。